Юрий Петрович Щекочихин родился 9 июня 1950 года в городе Кировабаде Азербайджанской ССР (ныне — Азербайджан) в семье военнослужащего.
В 1975 году окончил факультет журналистики Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова.
С 1967 по 1971 год работал стажером, затем — корреспондентом газеты "Московский комсомолец".
В 1972-1980 годах — корреспондент газеты "Комсомольская правда", редактор приложения "Алый парус".
С 1980 года работал в еженедельнике "Литературная газета" ("ЛГ") специальным корреспондентом, затем редактором отдела расследований. До 1996 года был членом редакционной коллегии "ЛГ".
С июля 1996 года работал заместителем главного редактора, редактором отдела расследований еженедельника "Новая газета. Понедельник".
С января по март 1997 года — заместитель главного редактора — ведущий редактор, с марта 1997 года — заместитель главного редактора — исполнительный редактор, затем заместитель главного редактора "Новой газеты", куратор отдела расследований.
В 1989 году Юрий Щекочихин был избран народным депутатом СССР.
В декабре 1995 года избран депутатом Государственной Думы Федерального Собрания РФ второго созыва (1995‑1999) по списку партии "Яблоко", а в декабре 1999 года — депутатом Государственной Думы ФС РФ третьего созыва (1999‑2003). Занимал пост заместителя председателя комитета Госдумы по безопасности.
С 1988 по 1989 год был членом исполкома оргкомитета историко‑просветительского общества "Мемориал". С 1988 года — член общественно‑политического объединения "Московская трибуна". С 1993 года — президент Международного фонда в поддержку молодой творческой интеллигенции. Эксперт ООН по организованной преступности.
Щекочихин был членом Союза российских писателей. Он автор пьес и киносценариев, посвященных проблемам подростков, художественной прозы и публицистики. В 1999 году вышла книга Щекочихина "Рабы ГБ. 20 век. Религия предательства".
В 1988 году по его сценариям были сняты художественные фильмы "Меня зовут Арлекино", "Щенок", "Комментарий к прошению о помиловании".
Публицист был награжден медалями "Защитнику свободной России" и "В память 850-летия Москвы".
3 июля 2003 года Юрий Щекочихин скончался.
Щекочихин был женат, у него остались два сына — Константин и Дмитрий.
Материал подготовлен на основе информации РИА Новости и открытых источников