Сергей Дмитриевич Шаталов родился 2 января 1950 года в городе Пскове.
В 1972 году окончил Ленинградский государственный университет по специальности "математик"; в 1981 году — аспирантуру Ленинградского политехнического института (ныне Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого). Кандидат физико-математических наук. Доктор экономических наук.
В 1973-1978 годах — ассистент, старший преподаватель кафедры теоретической механики Псковского филиала Ленинградского политехнического института.
В 1978-1981 годах — аспирант Ленинградского политехнического института.
В 1981-1990 годах — доцент Псковского филиала Ленинградского политехнического института.
В 1990-1993 годах — народный депутат, председатель подкомиссии по налоговой политике, секретарь Комиссии Совета Республики по бюджету, планам, налогам и ценам Верховного Совета РФ.
В 1993-1995 годах — директор налогового департамента АО "Центр по иностранным инвестициям и приватизации".
В 1995-1998 годах — заместитель министра финансов РФ.
В 1998-2000 годах — директор Управления налогообложения фирмы "Прайсутерхаус энд Ко", ЗАО "Прайсутерхаус Куперс Аудит".
С января 2000 года по апрель 2004 года занимал должность первого заместителя министра финансов РФ (статс-секретаря).
С апреля 2004 года по октябрь 2005 года — заместитель министра финансов РФ.
С ноября 2005 года по июнь 2013 года — статс-секретарь — заместитель министра финансов РФ.
С 27 июня 2013 года — заместитель министра финансов РФ. В Минфине Шаталов курировал налоговую политику.
18 января 2016 года освобожден от должности в связи с выходом на пенсию.
Сергей Шаталов награжден орденом "За заслуги перед Отечеством" IV степени (2007), медалью "Защитнику свободной России" (1997).
Имеет благодарности президента РФ (2001), правительства РФ (2000, 2001), министра финансов Российской Федерации (2009, 2012).
Отмечен Почетной грамотой президента Российской Федерации (2010).
Женат, есть сын и дочь.
Сумма задекларированного дохода за 2014 год — более 43 миллионов рублей.
Материал подготовлен на основе информации РИА Новости и открытых источников