МОСКВА, 22 июл – РИА Новости. Сотрудники Института биоорганической химии РАН создали программу, позволяющую анализировать множество геномов и анализировать свойства иммунной системы человека, что ускорит поиски методов лечения болезней, связанных с нарушением иммунитета, говорится в статье, опубликованной в журнале BMC Genomics.
"Наша программа оптимизирует работу исследователей и поможет разработать и проверить новые гипотезы о формировании и работе системы адаптивного иммунитета. Что особенно важно, анализ таких данных важен не только для теоретических исследований, но и практических задач. Например, новые знания в этой области необходимы для разработки новых методов лечения автоиммунных болезней, рака, а также аллергий", — заявил Иван Звягин из Института биоорганической химии РАН в Москве, чьи слова приводит пресс-служба института.
Программа российских ученых – VDJviz — уже доступна для скачивания и ее может получить любой пользователь сети, посетивший сайт британского журнала, в котором опубликовано ее описание.
Как объясняет ученый, такое необычное название их программного продукта обусловлено тем, что она анализирует – сочетание особых фрагментов генома человека V, D и J, которые необходимы для формирования рецепторов иммунных клеток и антител. При "сборке" этих рецепторов к этим участкам добавляются случайные последовательности, в результате чего наша иммунная система в теории имеет возможности борьбы практически с любым патогеном. Нарушения в работе этой системы приводит к развитию аллергий и иммуннодефицитных заболеваний, а также аутоиммунных расстройств, таких как рассеянный склероз.
Такой процесс происходит в организме множество раз при созревании каждой В- или Т-клетки, в результате чего формируется огромный набор В- и Т-клеток, каждая из которых имеет уникальную структуру рецепторов, распознающих антигены. Сегодня ученые умеют "прочитывать" эти участки ДНК иммунных клеток, однако, благодаря огромному количеству их вариантов, обработка и анализ того, за что отвечает каждая комбинация, является крайне длительным и трудоемким занятием.
VDJviz поможет ученым экономить время и силы, при этом не обладая особыми навыками программирования и работы с компьютерным кодом. Команда ученых из ИБХ РАН подготовила как онлайн-, так и офлайн-версию этой системы анализа ДНК, что позволит ученым пользоваться ей наиболее удобным способом. Как надеются биологи, их разработка поможет нам раскрыть секреты работы адаптивного иммунитета человека и понять механизмы, вызывающие тяжелые болезни, связанные со сбоями в его работе.
