ЦРУ и Пентагон проводили программу допросов, сопровождавшихся пытками. Наибольшую известность получила инсценировка утопления, которую администрация Буша-младшего не считала пыткой. Пытки проводились в секретных тюрьмах по всему миру, где задержанных содержали длительный период времени без предъявления обвинений.
Сообщается, что АПА поддержала Пентагон, когда возникали этические вопросы о работе психологов, участвовавших в программе "допросов расширенными методами". В частности, директор по этике ассоциации пытался привести этические требования к психологам в соответствие с практикой пыток в Пентагоне. Ряд видных психологов помогали программе допросов и защищали ее от критики внутри Пентагона. Управление по этике "ставило защиту психологов, даже тех, кто мог вести себя неэтично, выше защиты общества", говорится в докладе.
Ранее сообщалось, что АПА тайно сотрудничала с представителями ЦРУ, Белого дома и Пентагона, чтобы разработать этическую политику в отношении допросов. Участие АПА позволило министерству юстиции утверждать, что система допросов ЦРУ законна и не предусматривает пыток, поскольку медики присутствовали во время допросов, чтобы убедиться в их безопасности. Представители АПА сотрудничество с ЦРУ отрицали.