Сергей Львович Байдаков родился 11 февраля 1965 года в городе Балашиха Московской области.
В 1988 году окончил Московский энергетический институт (МЭИ) по специальности "инженер‑электромеханик", в 1995 году ‑ Московскую государственную юридическую академию по специальности "юриспруденция". Кандидат юридических наук (1999).
В 1988‑1992 годах Сергей Байдаков работал в Московском энергетическом институте младшим научным сотрудником кафедры электро‑аппаратостроения, председателем профкома студентов, заместителем проректора МЭИ.
В 1990‑1992 годах избирался депутатом Калининского районного Совета народных депутатов Москвы.
В 1992‑1993 годах Сергей Байдаков был директором студенческого городка Московского энергетического института.
С 1993 по 1998 год работал первым заместителем супрефекта муниципального округа "Лефортово" Москвы. На этой должности курировал жилищно‑коммунальное хозяйство и занимался развитием инфраструктуры округа.
В 1999‑2000 годах был главой управы района "Лефортово".
С 2000 по 2003 год являлся первым заместителем префекта Центрального административного округа Москвы.
В 2003‑2008 годах Байдаков работал префектом Центрального административного округа города Москвы в ранге министра Правительства Москвы.
С 2008 года по 2010 год был заместителем мэра Москвы по вопросам межрегиональной политики, спорта и туризма. Курировал также рекламную отрасль, религию и ограничения в сфере игорного бизнеса в Москве.
26 октября 2010 года Байдаков назначен префектом Центрального административного округа (ЦАО) Москвы
18 декабря 2012 года префект Центрального административного округа Москвы Сергей Байдаков освобожден от занимаемой должности.
Награжден медалью ордена "За заслуги перед Отечеством" II степени, медалью 850-летия Москвы, премией Правительства Российской Федерации в области науки и техники.
Награжден орденами русской православной церкви, имеет награды зарубежных международных общественных организаций.
Увлекается спортом, является председателем Ассоциации уличного баскетбола России, президентом Федерации самбо Москвы, вице-президентом Всероссийской федерации самбо.
Женат, воспитывает сына и дочь.
Материал подготовлен на основе информации РИА Новости и открытых источников
