Преступление было совершено около 12.10 мск в момент, когда Юрий Буданов выходил из помещения нотариальной конторы, расположенной по адресу: Комсомольский проспект, дом 38/16. От полученных огнестрельных ранений в голову (по предварительным данным, киллер сделал не менее четырех точных выстрелов) Буданов скончался на месте происшествия.
На соседней улице - улице Доватора, был обнаружен частично сгоревший автомобиль Mitsubishi Lancer, на котором предположительно скрылся стрелявший. В салоне автомобиля обнаружен пистолет с глушителем. Уже составлен фоторобот предполагаемого убийцы. Возбуждено уголовное дело по части 2 статьи 105 УК РФ (убийство) и статье 222 (незаконный оборот оружия).
Бывший полковник был фигурантом одного из самых громких судебных процессов о преступлениях российских военных в Чечне. В июле 2003 г. решением военного суда был признан виновным в превышении должностных полномочий, похищении и убийстве чеченской девушки Эльзы Кунгаевой. Был приговорен к 10 годам колонии строгого режима с лишением воинского звания, государственных наград и возможности в течение трех лет после освобождения занимать руководящие посты.
Прошение Буданова об условно-досрочном освобождении было удовлетворено в декабре 2008 г., в январе 2009 г. он был выпущен из колонии.