Положением установлено, что госрегулирование железнодорожных тарифов осуществляют Федеральная служба по тарифам (ФСТ) и министерство транспорта.
ФСТ устанавливает тарифы на грузовые железнодорожные перевозки во внутригосударственном и международном сообщении (в том числе, на перевозки экспортно-импортных грузов), на перевозки пассажиров, багажа и грузобагажа во внутригосударственном сообщении. Минтранс устанавливает тарифы на международные транзитные железнодорожные перевозки по территории Российской Федерации.
Госрегулирование тарифов на железнодорожном транспорте основывается на следующих принципах: возмещение экономически обоснованных затрат субъектов естественной монополии на железнодорожном транспорте с учетом ежегодно устанавливаемых правительством уровней тарифов; распределение эксплуатационных расходов по видам перевозок; обеспечение равных условий доступа пользователей к услугам железнодорожного транспорта, в том числе к его инфраструктуре; установление для всех пользователей услуг железнодорожного транспорта единых правил, предусматривающих особые условия тарификации на железнодорожном транспорте.
Кроме того, госрегулирование предусматривает обеспечение гласности принятия решений, в том числе по вопросам установления и изменения уровня тарифов и правил их применения; соответствие системы построения тарифов рыночным условиям хозяйствования (переход по мере развития рыночных отношений и конкуренции от тарифов, регулируемых государством, к тарифам, определяемым на договорной основе); ведение раздельного учета затрат в естественно монопольном и потенциально конкурентном секторах транспортных услуг; ограничение перекрестного субсидирования одних видов деятельности за счет других.
Утвержденные правительством правила предоставления исключительных тарифов на железнодорожном транспорте устанавливают порядок предоставления тарифов, предусматривающих особые условия тарификации на железнодорожные перевозки и услуги по использованию инфраструктуры железнодорожного транспорта общего пользования.
Исключительные тарифы применяются с учетом условий перевозок, состояния рынков товаров и услуг, необходимости обеспечения конкурентоспособности транспортной системы, стимулирования развития новых технологий на железнодорожном транспорте и обеспечения равных условий предоставления услуг всем потребителям.
Предложения о предоставлении исключительных тарифов рассматривают ФСТ (во внутригосударственном и международном сообщении) и Минтранс (при осуществлении международных транзитных железнодорожных перевозок).
Предложения должны содержать технико-экономическое обоснование необходимости установления исключительных тарифов и ряд других материалов.