Самойлов Сергей Николаевич родился 22 ноября 1955 года.
Окончил педагогический институт, работал директором детского дома в городе Чите.
Избирался народным депутатом РСФСР (1990-1993), был членом Комитета Верховного Совета РСФСР по науке и народному образованию.
В 1991-1993 годах - представитель Президента РФ в Читинской области.
С мая 1993 года - заместитель начальника Управления Администрации Президента РФ по работе с территориями.
С 1996 года - начальник Территориального управления Администрации Президента РФ.
С 3 июня 2000 по февраль 2001 года - начальник Главного территориального управления Президента РФ.
С марта 2001 года - советник Президента РФ. В его ведении - территориальные вопросы.
30 марта 2004 года Указом Президента РФ вновь назначен советником Президента Российской Федерации.
Действительный государственный советник РФ 1 класса.
Женат, имеет троих детей.