В целях сокращения выбросов ОАО "Мосэнерго" проводит специальные природоохранные мероприятия. В течение 2002 года продолжалось оснащение ТЭС ОАО "Мосэнерго" приборами контроля выбросов оксидов азота. В настоящее время в целом по системе установлено свыше 100 таких приборов. На филиалах энергокомпании внедрялись кавитационные рыбозащитные устройства, современные технологии сжигания мазута, приборы контроля и учета выбросов вредных веществ, шумоглушители и т.д. Электростанции проводили реконструкцию и ремонт установок очистки вод, загрязненных нефтепродуктами, систем хранения, подогрева и подачи жидкого топлива для предотвращения протечек мазута.
Применение эффективного комплекса мер, направленных на улучшение экологического состояния воздушного и водного бассейнов в Москве и области, позволяет ОАО "Мосэнерго" в последние годы добиваться существенного сокращения выбросов вредных веществ в окружающую среду. Компания с успехом проводит природоохранные мероприятия, в том числе те, что предусмотрены целевой экологической программой правительства Москвы, рассчитанной на 1993-2010 годы.