Первые контакты между Россией и Ватиканом на государственном уровне восходят к концу XV века. Первое представительство России при Ватикане было аккредитовано в 1817 году.
В течение нескольких десятилетий Советский Союз оставался одним из наиболее закрытых для Ватикана государств. Период наибольшего потепления межгосударственных отношений пришелся на понтификат Павла VI (1963-1978). 30 января 1967 года в Ватикан впервые с официальным визитом прибыл председатель Президиума Верховного Совета СССР Николай Подгорный.
Дважды состоялись кратковременные встречи советского министра иностранных дел Андрея Громыко с епископами Рима: первая встреча состоялась в Нью-Йорке 4 октября 1965 года, где на заседании ООН с приветственным словом выступил Павел VI. Сам папа четыре раза принимал у себя главу советского дипломатического корпуса: первый раз неофициально 27 апреля 1966 года, затем 12 ноября 1970 года, 21 февраля 1974 года и 28 июня 1975 года. Дважды встречался с Громыко Иоанн Павел II: 24 января 1979 года и 27 февраля 1985 года. Результатами каждой из этих встреч было незначительное смягчение политики советского государства в отношении религии вообще и католической церкви, в частности.
15 марта 1990 года Советский Союз и Ватикан установили официальные отношения. После распада СССР, 5 сентября 1991 года, Ватикан признал независимость и суверенитет Российской Федерации.
20 декабря 1991 года официальный визит в Ватикан совершил первый российский президент Борис Ельцин. Второй раз Борис Ельцин был принят папой Иоанном Павлом II 10 февраля 1998 года. Также дважды Иоанн Павел II принимал второго российского президента — Владимира Путина: в июне 2000 года и ноябре 2003 года.
13 марта 2007 года Владимир Путин встретился в Ватикане с папой Бенедиктом XVI.
3 декабря 2009 года с рабочим визитом Ватикан посетил президент РФ Дмитрий Медведев, где был принят папой Бенедиктом XVI. В ходе этой встречи было выражено намерение повысить уровень отношений между Россией и Святым Престолом.
9 декабря 2009 года Российская Федерация и Святой Престол обменялись нотами об установлении дипломатических отношений на уровне Посольства РФ в Ватикане и Апостольской нунциатуры в Российской Федерации.
17 февраля 2011 года состоялся первый после установления полноформатных дипотношений официальный визит президента России Дмитрия Медведева в Ватикан.
Основной темой беседы Дмитрия Медведева и Бенедикта XVI стали перспективы сотрудничества в гуманитарной и социальной сферах, по линии науки, образования, культуры. Отдельно обсуждались вопросы развития межконфессионального диалога.
По окончании аудиенции у папы римского Медведев провел краткую встречу с государственным секретарем Ватикана, кардиналом Тарчизио Бертоне.
25 ноября 2013 года президент России Владимир Путин встретился в Ватикане с папой римским Франциском. Беседа проходила с глазу на глаз в зале библиотеки Ватикана, где обычно проходят встречи на высшем уровне, и длилась 35 минут. Владимир Путин подарил понтифику икону Владимирской Божьей матери. В ответ папа Франциск подарил российскому лидеру майолику с изображением Ватиканских садов, а при прощании просил президента России передать привет патриарху Кириллу.
Развиваются контакты на уровне глав внешнеполитических ведомств обеих стран. 13 марта 2007 года во время встречи Путина и Бенедикта XVI прошли отдельные переговоры министра иностранных дел Российской Федерации Сергея Лаврова с государственным секретарем Святого Престола кардиналом Тарчизио Бертоне и секретарем по отношениям с государствами Домиником Мамберти. 23 марта 2009 года Мамберти посетил Москву, где состоялись его переговоры с Сергеем Лавровым.
13 июня 2011 года прошли российско-ватиканские политконсультации на уровне заместителей глав внешнеполитических ведомств (не проводились с 2002 года) — заместитель министра иностранных дел РФ Александр Грушко провел переговоры в Ватикане с заместителем секретаря по отношениям с государствами Этторе Балестреро.
Россия и Ватикан поддерживают контакты по линии ООН, а также других международных организаций, прежде всего ОБСЕ и Совета Европы. Активно развивается двустороннее сотрудничество в области науки, образования и культуры.
Материал подготовлен на основе информации РИА Новости и открытых источников