Дипломатические отношения между Российской Федерацией и Киргизией установлены 20 марта 1992 года. Договорно-правовую базу составляют порядка 150 двусторонних межгосударственных и межправительственных договоров и соглашений. 10 июня 1992 года был подписан Договор о дружбе, сотрудничестве и взаимной помощи между Российской Федерацией и Киргизской Республикой, 27 июля 2000 года — российско-киргизская Декларация о вечной дружбе, союзничестве и партнерстве.
Киргизия — стратегический партнер и союзник России в Центральной Азии. Российско-киргизское сотрудничество носит многоплановый характер, характеризуется близостью подходов к международным и региональным делам, нацеленностью на развитие евразийских интеграционных процессов.
Российско-киргизские контакты на высшем уровне носят интенсивный характер.
В 2015 году главы государств встречались шесть раз: 7 февраля в Сочи, 16 марта и 19 июня в Санкт-Петербурге, 9 июля в Уфе, 15 сентября в Душанбе и 8 октября в Сочи.
В 2016 году встречи президентов Владимира Путина и Алмазбека Атамбаева на высшем уровне состоялись 2 марта в Москве, 17 сентября в Бишкеке "на полях" саммита СНГ и 26 декабря в Санкт-Петербурге, где главы государств приняли участие в заседании Высшего Евразийского экономического совета и сессии Совета коллективной безопасности Организации Договора о коллективной безопасности.
28 февраля 2017 года президент России посетил с официальным визитом Киргизию. В Бишкеке состоялись переговоры Владимира Путина с президентом Киргизии Алмазбеком Атамбаевым. Обсуждались вопросы российско-киргизского сотрудничества в политической, экономической и гуманитарной областях, перспективы расширения кооперации в рамках Евразийского экономического союза.
По итогам переговоров был подписан ряд документов о сотрудничестве.
14 апреля 2017 года президент России Владимир Путин вновь посетил Киргизию, где принял участие в заседании Высшего Евразийского экономического совета и в неформальной встрече глав государств — членов Организации Договора о коллективной безопасности.
9 июня 2017 года лидеры России и Киргизии приняли участие в заседании Совета глав государств — членов Шанхайской организации сотрудничества.
19-23 июня 2017 года по приглашению Владимира Путина президент Киргизии Алмазбек Атамбаев посетил Россию с государственным визитом.
19 июня Владимир Путин и Алмазбек Атамбаев провели в Кремле неформальную встречу. 20 июня состоялись переговоры на высшем уровне. Обсуждались актуальные вопросы двусторонних отношений. По итогам визита был подписан пакет межведомственных соглашений о сотрудничестве. Владимир Путин и Алмазбек Атамбаев подписали Декларацию об укреплении союзничества и стратегического партнерства между Российской Федерацией и Киргизской Республикой.
В ходе визита Алмазбек Атамбаев также встретился с премьер-министром России Дмитрием Медведевым.
14 сентября 2017 года президент Киргизии Алмазбек Атамбаев посетил Россию с рабочим визитом. Переговоры на высшем уровне прошли в Сочи, обсуждались различные вопросы российско-киргизского сотрудничества.
7 октября 2017 года президент России Владимир Путин и президент Киргизии Алмазбек Атамбаев приняли участие в заседаниях Совета глав государств СНГ и Высшего Евразийского экономического совета в Сочи.
17 ноября 2017 года президент Киргизии Алмазбек Атамбаев посетил Россию с рабочим визитом для участия в мероприятиях Санкт-Петербургского международного культурного форума. В ходе встречи на высшем уровне Алмазбек Атамбаев, завершающий свою деятельность на посту главы Киргизии, и Владимир Путин обсудили результаты многолетнего сотрудничества двух стран в интересах укрепления всего комплекса российско-киргизских отношений.
Регулярный характер носят встречи на уровне премьер-министров двух стран.
29 сентября 2017 года в Москве состоялась встреча председателя правительства России Дмитрия Медведева с премьер-министром Киргизии Сапаром Исаковым в рамках его официального визита в Россию. В ходе переговоров обсуждались актуальные вопросы двусторонних отношений, включая тематику сотрудничества в торгово-экономической, инвестиционной, энергетической и культурно-гуманитарной областях.
25 октября Дмитрий Медведев также встречался с Сапаром Исаковым "на полях" заседания Евразийского межправительственного совета в Ереване.
Динамично развивается российско-киргизское взаимодействие по линии внешнеполитических ведомств. В 2016 году главы МИД двух стран провели переговоры 23 мая в Ташкенте (в рамках заседания СМИД ШОС) и 16 сентября в Бишкеке ("на полях" СМИД СНГ). 2-4 апреля 2017 года состоялся рабочий визит министра иностранных дел Киргизии Эрлана Абдылдаева в Москву.
Поддерживаются межпарламентские связи, осуществляются контакты на уровне министерств и ведомств.
Динамично развивается торгово-экономическое сотрудничество России и Киргизии. Россия — ведущий торговый партнер Киргизии с долей около 20% во внешнем товарообороте республики.
По данным Федеральной таможенной службы РФ, в 2016 году двусторонний оборот в стоимостном выражении составил 1,196 миллиарда долларов (на 12,9% меньше по сравнению с 2015 году), при этом российский экспорт — 1,026 миллиарда долларов (снижение на 21,6%).
Сокращение стоимостного объема товарооборота в 2016 году обусловлено общей неблагоприятной финансово-экономической ситуацией на мировых рынках, замедлением темпов экономического роста, нестабильностью валютных курсов. Вместе с тем в 2016 году отмечен рост поставок товаров из Киргизии в Россию — на 138% по сравнению с 2015 годом — до 170,5 миллиона долларов. Причем, по таким значимым для экспорта Киргизии товарам как продовольствие и сельхозсырье (32% от общего объема экспорта) наблюдалось увеличение физических объемов поставок в 1,6 раза (до 16,6 тысячи тонн).
В структуре экспорта России в Киргизию в 2016 году основная доля поставок пришлась на следующие виды товаров: минеральные продукты (38,09% от всего объема экспорта России в Киргизию); продовольственные товары и сельскохозяйственное сырье (17,62%); металлы и изделия из них (12,91%); продукция химической промышленности (12,63%); машины, оборудование и транспортные средства (8,96%); древесина и целлюлозно-бумажные изделия (5,07%); текстиль и обувь (1,02%).
Структуру российского импорта составляли следующие группы товаров: машины, оборудование и транспортные средства (31,62% от всего объема импорта России из Киргизии); металлы и изделия из них (22,64%); текстиль и обувь (16,17%); продовольственные товары и сельскохозяйственное сырье (12,64%); продукция химической промышленности (8,35%).
По итогам января-сентября 2017 года, внешнеторговый оборот России и Киргизии составил 1138,5 миллиона долларов, в том числе российский экспорт — 1004,7 миллиона долларов и импорт — 133,8 миллиона долларов.
Действует Межправительственная Российско-Киргизская комиссия (МПК) по торгово-экономическому, научно-техническому и гуманитарному сотрудничеству (создана 10 октября 1997 года). Последнее заседание МПК состоялось 17 февраля 2017 года в Москве.
В 2015 году был дан старт практической работе Российско-Киргизского Фонда развития (соглашение, регулирующее его деятельность, подписано 24 ноября 2014 года), созданного в целях содействия модернизации ряда отраслей экономики Киргизской Республики. В мае 2016 года российской стороной завершено формирование его уставного капитала в размере 500 миллионов долларов. В настоящее время утверждены и реализуется 23 проекта по типу "прямого финансирования", а также около 650 проектов в рамках кредитов коммерческим банкам Киргизии по программам поддержки малого и среднего бизнеса на общую сумму более 200 миллионов долларов.
Одним из ключевых направлений экономического сотрудничества является газовая отрасль. Во исполнение двустороннего межправительственного соглашения о сотрудничестве в сфере транспортировки, распределения и реализации природного газа на территории Киргизской Республики от 26 июля 2013 года ПАО "Газпром" ведет работу по бесперебойному обеспечению потребностей республики в газе. В рамках Генеральной схемы газоснабжения и газификации Киргизской Республики до 2030 года (утверждена 30 января 2015 года) общий объем инвестиций ПАО "Газпром" в газотранспортную и газораспределительную систему Киргизии составит 100 миллиардов рублей, из которых 35 миллиардов рублей было запланировано вложить в 2015-2017 годах. Предполагается, что по итогам реализации упомянутых планов уровень газификации республики вырастет с нынешних 22% до 60%.
По итогам 2016 года Россия заняла первое место в общем объеме прямых иностранных инвестиций в Киргизию с долей 44%.
Важной составной частью всего комплекса российско-киргизских отношений являются военное и военно-техническое сотрудничество. На территории Киргизии находится объединенная российская военная база. В ее составе четыре объекта: аэродром Коллективных сил быстрого реагирования ОДКБ в Канте, испытательная военно-морская база на Иссык-Куле, узел связи в поселке Чалдовар и автономный сейсмический пункт в городе Майлуу-Суу.
Приоритетные направления сотрудничества в гуманитарной сфере — образование и культура, укрепление в Киргизии позиций русского языка.
Реализуется Программа сотрудничества между Министерством культуры Российской Федерации и Министерством культуры, информации и туризма Киргизской Республики на 2015-2017 годы. В 2016 году в Киргизии с успехом прошли Дни культуры России и Неделя российского кино. Ответные Дни культуры Киргизии в России состоялись в июне 2017 года.
Укрепляются связи в образовательной сфере. Важнейшую роль в этом плане играет Киргизско-Российский Славянский университет, открытый в Бишкеке в 1993 году.
С июня 2011 года в Бишкеке работает Российский центр науки и культуры (РЦНК). В декабре 2016 года филиал РЦНК открылся в городе Ош.