Сценарист, драматург, телекритик, педагог, исследователь теории телевидения и документального кино Сергей Муратов родился 1 мая 1931 года в Харькове.
Окончил Московский государственный институт международных отношений (МГИМО). Будучи студентом, зарабатывал как автор радиопьес, радиосказок, радиопоэм. По окончании МГИМО получил свободный диплом и стал работать на телевидении.
В 1956 году основал первую в стране молодёжную редакцию под названием "Фестивальная". С друзьями — студентом-медиком Альбертом Аксельродом и инженером Михаилом Яковлевым придумали, не имеющую аналогов в мире, игру — "КВН".
С 1958 года сотрудничал с телевидением внештатно. В 1960-е годы ежемесячные обзоры в газете "Советская культура" и журнале "Журналист", где Муратов работал обозревателем, стали первым опытом создания периодической телекритики в стране.
С 1968 года преподавал на кафедре телевидения факультета журналистики МГУ.
Автор множества сценариев документальных телефильмов, спектаклей и различных программ. Известен как учёный-исследователь по проблемам теории и практики телепублицистики и телекино. Муратов стал автором уникальных учебных методик. Его "Активные методы обучения в телевизионной журналистике" легли в основу практических занятий со студентами на всех факультетах журналистики страны. Сергей Муратов написал множество монографий, в числе которых "Пристрастная камера" (1976), "Диалог" (1983), "Встречная исповедь" (1988), "Нравственные принципы тележурналистики" (1997), "ТВ: эволюция нетерпимости" (2000), "Телевидение в поисках телевидения" (2001), "Телевизионное общение в кадре и за кадром" (2003).
Муратов имел сотни публикаций в теоретических сборниках, специализированных изданиях и научных журналах, в ряде учебных пособий.
Был активным участником зарубежных научных конгрессов и встреч по телевидению и документальному кино в США, Великобритании, Германии. Входил в число постоянных руководителей семинара кинодокументалистов (Рига, Латвия). Принимал участие в ежегодных аналитических заседаниях рабочей группы Американо-российской комиссии по политике телевидения в Вашингтоне. В прошлом являлся содиректором Российской комиссии по политике телевидения.Сергей Муратов принадлежал к числу экспертов в консультативных советах "Интерньюса" и Фонда Сороса. Являлся членом Академии Российского телевидения "ТЭФИ" и Академии Союза кинематографистов "Ника".
Муратов был профессором, доктором философских наук.
В 1999 году ему было присвоено звание Заслуженного деятеля искусств.
Скончался в Москве 8 февраля 2015 года после продолжительной болезни.