Юрий Валентинович Лончаков родился 4 марта 1965 года в городе Балхаше Джезказганской области Казахстана.
Во время учебы в школе занимался в радиошколе ДОСААФ (1978-1982) и в Школе юных летчиков им. В.И. Пацаева при Актюбинском высшем летном училище гражданской авиации (1979-1982).
В 1986 году окончил с золотой медалью Оренбургское Высшее военное авиационное училище летчиков им. И.С. Полбина по специальности "Командная тактическая морская ракетоносная авиация"; в 1998 году — факультет "Самолеты и двигатели" Военно-воздушной инженерной академии им. Н.Е. Жуковского по специальности "Испытания летательных аппаратов и их систем", получил квалификацию летчик-инженер-исследователь; в 2006 году — Российскую академию госслужбы при президенте РФ по специальности "Государственное и муниципальное управление".
С декабря 1986 года Юрий Лончаков служил в должности помощника командира корабля, с февраля 1989 года — командира корабля 12-го отдельного морского ракетоносного авиационного полка Военно-воздушных сил Балтийского флота (город Остров Псковской области).
В 1989-1991 годах — командир корабля эскадрильи самолетов Ту-16 в составе 240-го гвардейского морского ракетоносного авиаполка Балтийского флота (город Быхов Могилевской области Белоруссии).
С марта 1991 года служил старшим летчиком Су-24 15-го отдельного дальне-разведывательного авиационного полка ВВС Балтийского флота (Калининград).
С июля 1991 года — старший летчик Су-24М, с июля 1992 года — командир авиационного отряда Отдельного государственного испытательного центра ПВО (город Приозерск Джезказганской области Казахстана).
С июня 1994 года — командир корабля, в январе-августе 1995 года — командир авиационного отряда 144-го отдельного полка ПВО самолетов А-50 (город Печора).
В июле 1997 года Юрий Лончаков решением Государственной межведомственной комиссии был рекомендован к зачислению в отряд космонавтов (12-й набор), в июне 1998 года был назначен на должность кандидата в космонавты-испытатели отряда космонавтов.
В 1998-1999 годах прошел курс общекосмической подготовки с присвоением квалификации "космонавт-испытатель".
В 2000-2001 годах проходил подготовку по различным программам полетов на Международной космической станции (МКС).
С ноября 2004 года был командиром отряда космонавтов Центра подготовки космонавтов.
Первый космический полет совершил в качестве специалиста с 19 апреля по 1 мая 2001 года на американском орбитальном многоразовом корабле "Индевор" (Endeavour) и МКС; второй космический полет совершил 30 октября — 10 ноября 2002 года в качестве бортинженера экспедиции посещения МКС вместе с российским космонавтом Сергеем Залетиным и астронавтом Европейского космического агентства бельгийцем Франком де Винне (старт и возвращение с МКС на российских космических кораблях серии "Союз ТМ").
В третий раз Юрий Лончаков отправился в космос 12 октября 2008 года в качестве командира корабля "Союз ТМА-13" и бортинженером 18-й основной экспедиции МКС вместе с астронавтами Майклом Финком и Ричардом Гэрриотом. Во время полёта выполнил два выхода в открытый космос общей продолжительностью 10 часов 45 минут. Вернулся на Землю 8 апреля 2009 года. Продолжительность полёта Юрия Лончакова составила 178 суток.
В сентябре 2013 года ушел из отряда космонавтов по собственному желанию.
С октября 2013 года по март 2014 года — советник руководителя Роскосмоса.
31 марта 2014 года Юрий Лончаков был назначен исполняющим обязанности начальника Центра подготовки космонавтов имени Гагарина.
Лончаков — Герой Российской Федерации (2003), лётчик-космонавт Российской Федерации (2003).
Доктор технических наук (2010), имеет более 40 научных работ. Является кандидатом в мастера спорта по дзюдо (1980) и радиоспорту (спортивному ориентированию, 1981).
Награжден орденом "За заслуги перед Отечеством" IV степени (2010), медалями.
Лончаков женат, у него есть сын.
Материал подготовлен на основе информации РИА Новости и открытых источников