Сергей Евгеньевич Ильиных родился 2 февраля 1975 года в Томске. В 1997 году с отличием окончил экономический факультет Томского государственного университета по специальности "Финансы и кредит".Трудовую деятельность начал в 1995 году специалистом управления кредитования АСБ "Томск-Резерв". С 1997 по 2005 годы работал в бизнес-структурах.
В 2005 году назначен заместителем главы администрации Асиновского района по социально-экономическому развитию. В этом же году был избран главой Асиновского района. С июля 2007 года - первый заместитель губернатора Томской области по социальной политике. В апреле 2009 года занял пост первого заместителя губернатора Томской области по социальной, кадровой и информационной политике.
В 2010 году избран депутатом думы Томска V созыва по списку "Единой России".18 октября 2010 года избран секретарем (руководителем) регионального отделения партии "Единая Россия". 22 октября депутаты гордумы избрали Ильиных спикером городского парламента.
С декабря 2010 по декабрь 2011 года был президентом ФК "Томь".
Женат, воспитывает двух дочерей.
