Монастырь Коренная Рождества Богородичная мужская пустынь основан в 1597 году на месте явления чудотворной иконы Божией Матери «Знамение», именуемой Коренною, или Курскою.
По легенде, 8 сентября 1295 года два охотника нашли в местечке, находящемся в 28 км от Курска «близь реки Тускари в полугоре, у корня большого дерева лежащую ниц икону». Один из охотников поднял икону, и из того места, где лежала икона в тот же миг начал проистекать родник. В память об увиденном чуде и обретении иконы «Знамение Божией Матери», ими была построена часовня.
В 1597 году по указу царя Федора Иоанновича на месте обретения чудотворной иконы был открыт монастырь - Курская Коренная Рождества-Богородицкая Пустынь. Тогда же здесь был создан целый комплекс церквей.
Церквей было пять: соборный храм в честь Рождества Богородицы, в честь иконы Божией Матери «Живоносный Источник», храм Всех святых, в честь Казанской и Курской Коренной икон Божией Матери. Здесь находилась копия со Знаменской иконы Божией Матери, присланная в 1664 году царями Иоанном и Петром Алексеевичами. В церкви Живоносного Источника, сооруженной близ места явления святой иконы, посредине находился квадратный водоем, огражденный железною решеткой, в который протекала вода от места явления. С южной стороны храма была пристроена часовня, сооруженная, по преданию, на том самом месте, где явилась святая икона.
В Смутные времена на Руси Коренная пустынь была разрушена до основания.
С 1618 по 1764 годы пустынь была приписана к Курскому Знаменскому монастырю. С 1764 года – нештатная общежительная мужская пустынь. В 1792 году в ней было устроено общежитие.
В 1924 году монастырь был закрыт. Были разрушены собор, колокольня, храмы, Святые врата. На территории располагались воинская часть, туберкулезный санаторий, училище. Святой источник залили бетоном.
В 1989 году началось возрождение монастыря. В 1990 году монастырь был вновь открыт. Были отреставрированы храмы Всех святых и в честь иконы Божией Матери «Живоносный Источник», колокольни и часовни, собор Рождества Богородицы.
Как и прежде, в Коренную пустынь устремляются тысячи паломников. Здесь ежегодно проводится Коренская ярмарка, которая была возрождена в 2001 году. Как и в былые времена, ярмарка приурочена к летнему Крестному ходу с иконой Божьей Матери «Знамение» из Курска в Коренную пустынь.
