25 апреля 2005 года управление Росприроднадзора по Волгоградской области, с привлечением специалистов Министерства природных ресурсов (МПР) России, начало выездную проверку территории ансамбля памятника «Героям Сталинградской битвы на Мамаевом кургане». В первый же день ревизии выяснилось, что на землях, находящихся в составе особо охраняемых природных территорий федерального значения, было построено два автозаправочных комплекса, а также торговый павильон, непосредственно премыкающий к мемориалу. При этом никаких правоустанавливающих документов на занимаемую территорию у представителей коммерческих структур обнаружено не было.
Выяснилось, что в целом территория ансамбля уменьшилась на 183 гектара: согласно проектным документам, за памятником закреплена площадь земельного участка в 360 гектаров, однако из представленных в адрес МПР России документов из администрации города Волгограда следовало, что площадь, занимаемая Мамаевым курганом, равнялась лишь 177 гектарам.
В июле 2005 года Генпрокуратура РФ постановила убрать торговые павильоны и другие объекты, незаконно возведенные на территории Мамаева кургана. Генпрокуратура предложила прокурору Волгоградской области незамедлительно «принять меры прокурорского реагирования, направленные на вынос указанных зданий и сооружений с территории памятника». Кроме того прокуратурой было отменено решение комиссии по градостроительству и земельным отношениям администрации Волгограда о предоставлении земельного участка под размещение горнолыжных спусков на склоне Мамаева кургана. К административной ответственности было привлечено руководство МУП «Зеленхоз» и ФГУП ГТРК «Волгоград ТРВ», сваливавших мусор на территории Мамаева кургана. Также к административной ответственности был привлечен предприниматель, проводивший реконструкцию торгового павильона «Культурный центр «Сталинград» без положительного заключения государственной экологической экспертизы.
1 июня 2005 года Министерство природных ресурсов РФ и Росприроднадзор начали проверку соблюдения природоохранного законодательства на территории Историко мемориального заповедника «Родина В.И. Ленина» (город Ульяновск). Проверка была проведена по запросам ряда депутатов Госдумы РФ, обративших внимание МПР России на массовые случаи застроек территории мемориального заповедника, которые сопровождались незаконными вырубками деревьев и нарушением основ природоохранного законодательства.
В ходе проверки выяснилось, в частности, что из 173,8 гектаров земли, выделенных заповеднику Советом Министров СССР, на балансе комплекса осталось лишь 6,01 гектар.
Выяснилось также, что на территории заповедника ряд строений был возведен без оформления разрешительных документов; кроме того, в нарушение Водного кодекса РФ, по ул. Ленина, в водоохранной зоне реки Свияги на месте домов старинной постройки были возведены коттеджи современной планировки.
В дальнейшем в СМИ не появлялись сообщения о том, что результаты проверки были переданы в прокуратуру.
С заповедником «Родина В.И.Ленина» связан еще один случай несанкционированного строительства в марте 2008 года Ленинский районный суд города Ульяновска обязал индивидуального застройщика снести верхние этажи строящегося на территории заповедника 4 этажного здания из за того, что новостройка портит вид памятника архитектуры начала 20 века.
В июне 2006 года СМИ со ссылкой на заместителя руководителя фракции «Единая Россия» Валерия Рязанского сообщали о намерении Госдумы РФ рассмотреть проект запроса в Генпрокуратуру по ситуации вокруг Государственного природного музея заповедника И.С.Тургенева «Спасское-Лутовиново» в Орловской области. Проект запроса касался незаконного отчуждения земель заповедника в пользу помощника лидера партии и думской фракции КПРФ Геннадия Зюганова Александра Тарнаева. Зампредседателя думского комитета по информационной политике Павел Пожигайло направил устный запрос руководству музея заповедника. В ответном документе, поступившем в Госдуму за подписью директора музея Николая Левина, отмечалось, что летом 2002 года, после посещения села Спасское-Лутовиново, директору музея позвонил Геннадий Зюганов и попросил разрешение на строительство вблизи музея пчеловодческой пасеки для своего помощника Александра Тарнаева. Как отмечалось в письме, в ответ Зюганову было заявлено, что размещение пасеки вблизи музея нежелательно; однако земли были выделены постановлением главы сельской администрации, на заповедной территории был выкопан пруд, а на соседнем участке возведены два дачных дома с размещением на них пасеки. Руководство музея, отмечалось в письме, направило запрос в прокуратуру Орловской области, по итогам проверки было вынесено представление, однако никаких действий по исправлению ситуации местная администрация не предприняла. В свою очередь в пресс службе фракции КПРФ заявили, что земли, о которых идет речь, не являются заповедными.
Также, как в случае с заповедником «Родина В.И. Ленина» это случай не получил продолжения в прессе. В СМИ не было упоминаний какого-либо решения властей по этому вопросу.
В июне 2006 года Прокуратура Москвы пресекла незаконное строительство на территории музея заповедника «Коломенское». В ходе проверки, проведенной совместно со специалистами Южного административного округа, выяснилось, что строители кафе «Охотничий домик» нарушили экологическое законодательство. В результате к дисциплинарной ответственности были привлечены должностные лица фирмы нарушителя и музея заповедника «Коломенское», а здание кафе было полностью демонтировано.
В апреле 2008 года Арбитражный суд России вернул государству земельные участки музея заповедника «Абрамцево», которые отдал под застройку частным лицам глава Сергиево Посадского района. В общей сложности незаконное решение главы районной администрации коснулось участков на 0,06 гектарах земли, которые были проданы или сданы в аренду, а также 11 участков размерами до 0,25 гектарах в районе деревень Быково и Глебово, которые неправомерно выделялись под индивидуальное жилищное строительство. Суд удовлетворил требования прокурора о признании недействительными постановлений главы Сергиево Посадского района. К апрелю 2008 года все участки были переданы государству.
В июле 2008 года суд запретил женщине предпринимателю строить частный дом на территории государственного заповедника «Музей усадьба Льва Толстого «Ясная Поляна». Еще в марте 2008 года жительница Тульской области купила в охранной зоне музея усадьбы земельный участок, на котором располагалась часть жилого дома, построенного до 1917 года. В апреле женщина снесла эту и еще несколько построек и одновременно рядом возвела новый фундамент размером 9 на 12 метров. Снос части дома и начавшееся строительство в охранной зоне были произведены без согласования с администрацией заповедника. Тульский природоохранный прокурор направил в связи с этим в Щекинский городской суд исковое заявление о признании действий женщины незаконными и запрещении строительных работ на участке. Исковые требования прокурора были удовлетворены в полном объеме.
