Положением о Федеральном агентстве железнодорожного транспорта установлено, что до утверждения правительством перечня подведомственных организаций федеральных органов исполнительной власти в ведении агентства находятся организации железнодорожного транспорта, находившиеся в ведении министерства путей сообщения.
Кроме того, агентство будет осуществлять от имени Российской Федерации полномочия акционера советско-монгольского акционерного общества "Улан-Баторская железная дорога", образованного в соответствии с Соглашением между правительством СССР и правительством Монгольской Народной Республики от 6 июня 1949 года.
Постановлением о Федеральном агентстве геодезии и картографии установлено, что предельная численность работников центрального аппарата агентства не может превышать 92 человек (без персонала по охране и обслуживанию зданий), а численность работников его территориальных органов - 122 человек.
Агентству разрешено иметь трех заместителей руководителя и четыре управления по основным направлениям деятельности.
До внесения изменений в соответствующие нормативные правовые акты правительства лицензирование геодезической и картографической деятельности, а также государственный геодезический надзор за геодезической и картографической деятельностью осуществляются Федеральным агентством геодезии и картографии. Кроме того, до утверждения перечня подведомственных организаций федеральных органов исполнительной власти в ведении агентства будут находиться организации, находившиеся в ведении Федеральной службы геодезии и картографии России.