Председателем ВСБ является президент Молдавии, главнокомандующий Вооруженными силами страны Владимир Воронин. Секретарем ВСБ назначен начальник Службы Высшего совета безопасности Аппарата президента Молдавии Ион Морей.
В состав Высшего совета безопасности Молдавии входят председатель парламента, премьер-министр страны, председатель парламентской Комиссии по национальной безопасности, президент Академии наук, президент Национального банка, министр обороны, министр иностранных дел, министр экономики, министр финансов, министр внутренних дел, директор Службы информации и безопасности, начальник Департамента чрезвычайных ситуаций, директор Центра по борьбе с экономическими преступлениями и коррупцией, генеральный прокурор, глава (башкан) Гагаузии.
При ВСБ будут созданы комиссии по внутренней и внешней политике, по финансово-экономической политике, по социально-экологической политике, по антитеррористической политике, а также информационно-аналитический центр.
