Важнейшей задачей в деятельности госсанэпидслужбы является объединение информационных ресурсов для формирования Московского городского информационного фонда данных социально-гигиенического мониторинга.
В связи с осложнением эпидемиологической ситуации по атипичной пневмонии усилен санитарно-карантинный досмотр рейсов из стран Юго-Восточной Азии. Под особым контролем - медицинское обслуживание в торговых комплексах и на рынках Москвы, обеспечение дезинфекции транспортных средств.
Выполнялась городская Целевая комплексная программа по предупреждению распространения в Москве заболевания, передаваемого вирусом иммунодефицита человека /"АнтиВИЧ/СПИД"/, на выполнение которой из городского бюджета был выделен почти 1 млн руб. Объем финансирования новой утвержденной программы по профилактике этой инфекции составил около 2 млн рублей.
Большое внимание уделяется профилактике гриппа, других инфекций. На особом контроле - состояние здоровья детей.