Забота об охране окружающей среды является одним из приоритетных направлений в деятельности компании. Она участвует в утвержденной правительством Москвы "Программе экологических мероприятий на действующих энергетических объектах ОАО "Мосэнерго" на период до 2010 года", которая предусматривает работы по реконструкции существующих энергомощностей для повышения их "экологических" характеристик.
В 2003 году в связи со значительным ростом энергопотребления в московском регионе, в целом по энергосистеме, общий расход топлива увеличился на 4 проц. Несмотря на это, выбросы загрязняющих веществ возросли только на 1 проц по сравнению с предыдущим годом.
В настоящее время ни одно предприятие ОАО "Мосэнерго" не нарушает экологических норм, на большинстве уровень вредных выбросов меньше допустимых нормативов в несколько раз.