Согласно Положению, в числе основных задач Госкомрыболовства обозначена реализация государственной политики и осуществление государственного управления в сфере использования, изучения, сохранения и воспроизводства водных биологических ресурсов и среды их обитания в поверхностных водных объектах, во внутренних морских водах, в территориальном море, на континентальном шельфе и в исключительной экономической зоне России, а также в открытой части Мирового океана.
В соответствие с Положением, Госкомрыболовства должно разрабатывать и представлять в правительство РФ предложения об общих допустимых уловах водных биологических ресурсов и квотах на их добычу. Комитет должен разрабатывать и утверждать правила рыболовства, районы и сроки промысла водных биоресурсов, научные программы и ежегодные планы морских ресурсных исследований.
Госкомрыболовства должно руководить работами по искусственному воспроизводству и акклиматизации водных биоресурсов, а также улучшению состояния водных объектов рыбохозяйственного назначения. Комитет должен определять и предоставлять в пользование рыбопромысловые участки для добычи водных биоресурсов.
Госкомрыболовства также осуществляет функции по выдаче и аннулированию лицензий на промысел водных биологических ресурсов. Это ведомство, помимо прочего, осуществляет и общее руководство деятельностью администраций морских рыбных портов, предоставляет право плавания под государственным флагом России судам рыбопромыслового флота, зарегистрированным в Реестре судов иностранного государства.
Председатель комитета и его заместители должны назначаться на должность и освобождаться от нее правительством Российской Федерации.
Проект Положения о Госкомитете по рыболовству занимает 10 страниц и подробно описывает задачи комитета, его функции, полномочия, и вопросы организации деятельности.
