Аудиторы палаты отметили, что реализация президентской программы развития Дубны как наукограда Российской Федерации на 2001-2006 гг. оказала "определенное положительное влияние на функционирование научно-производственного комплекса города. Однако проверкой выявлен ряд недостатков и упущений в финансовом обеспечении города. К ним аудиторы относят тот факт, что в приложении к федеральному бюджеты на 2002 год не были выделены отдельной строкой (в ведомственной структуре) средства непосредственно Дубне.
Девять из предусмотренных программой 23 контрольных показателей в 2002 году, по предварительной оценке, достигнуты не были. Такое отставание задерживает достижение поставленных целей - обеспечения устойчивого социально-экономического развития Дубны, мирового лидерства в фундаментальных научных исследованиях, создания новых технологий и соответствующей продукции и подготовки специалистов высокого уровня.
Аудиторы считают, что в формировании и использовании городского бюджета "отсутствует должная прозрачность". В 2002 году без проведения конкурсов размещены заказы по 19 из 38 мероприятий программы. Для развития города не используются внебюджетные средства, хотя это и предусмотрено указом президента РФ от 20 декабря 2001 года. На доходах Дубны сказывается снижение правительством Московской области нормативов отчислений в городской бюджет от налогов с физических лиц и на прибыль.
Коллегия приняла решение информировать о результатах проверки Минпромнауки и Минфин РФ, администрацию Дубны, правительство Московской области и обе палаты Федерального Собрания РФ.