Цель программы - определение приоритетных направлений научных исследований, формирование согласованной политики в области стандартизации и сертификации ветеринарных препаратов и создание общих для стран СНГ банков референтных и эпизоотических штаммов микроорганизмов, циркулирующих на их территории.
Программа предусматривает также разработку эффективных мер по профилактике, ликвидации и контролю особо опасных и экзотических болезней животных, фундаментальные исследования в области молекулярной биологии и осуществление согласованных подходов и критериев в сфере подготовки научных кадров.
Финансирование программы осуществляется за счет бюджетных средств национальных аграрных министерств, министерств науки и образования, а также академий сельскохозяйственных наук.
Участие в Межгосударственном совете СНГ по сотрудничеству в области ветеринарии приняли руководители ветслужб государств СНГ, Балтии, а также Польши.