В первый день процесса, 17 января, заседание суда закончилось оглашением государственным обвинителем от прокуратуры Дагестана Мухтаром Шапиевым обвинительного заключения. Через неделю, 24 января, все восемь подсудимых заявили, что ни по одному из предъявленных им обвинений они не признают себя виновными.
Назначенное на 3 февраля третье заседание военного суда начнется с продолжения допроса главного фигуранта по "делу о минах", 33-летнего начальника инженерной службы войсковой части 63354 подполковника Николая Ямкового. На предыдущем заседании его адвокат выступил с обвинениями в адрес следствия, заявив, что к Ямковому якобы применялись "недозволенные методы следствия".
На эти обвинения, ранее озвученные в СМИ, в конце августа прошлого года на пресс-конференции в Махачкале ответил заместитель Генпрокурора РФ Владимир Колесников. Он сообщил, что эти факты "были тщательно проверены и не нашли подтверждения". К подполковнику Ямковому, пояснил Колесников, "действительно 18 июня 2002 года в помещении Буйнакского отдела УБОП были применены физическая сила и спецсредства, так как в ходе беседы по выяснению движения боеприпасов, он неожиданно толкнул начальника отдела УБОП Сахаватого и выбежал из кабинета, пытаясь скрыться от следствия".
По факту применения к Ямковому физической силы и спецсредств, отметил Владимир Колесников, прокуратурой Буйнакска была проведена проверка. По ее результатам действия сотрудников милиции признаны правомерными, и 27 июня было принято решение об отказе в возбуждении уголовного дела.
1 августа прокуратурой Дагестана это решение было отменено, а следственному управлению прокуратуры получено провести дополнительную проверку, которая также подтвердила правомерность действий сотрудников органов внутренних дел по применению физической силы и спецсредств.
В начале процесса в различных СМИ это судебное расследование связывалось с трагическими событиями 9 мая 2002 года в городе Каспийске, когда праздничная демонстрация в честь Дня Победы была прервана террористическим актом, в результате которого погибли 45 человек.
Как пояснил корреспонденту РИА "Новости" начальник отдела следственного управления прокуратуры Дагестана Сейфудин Казиахмедов, следствие не связывает дело военнослужащих буйнакской бригады со взрывом в Каспийске. Речь идет лишь о "незаконном обороте боеприпасов", отметил он.