Как передает корреспондент РИА "Новости", министр подозревается в пресследовании людей за антисоветскую деятельность по сфабрикованным обвинениям в годы советской власти. В 1985 году Айна Сеппик, как член коллегии по уголовным делам Верховного суда Эстонской ССР, участвовал в осуждении четверых молодых людей на основании надуманных обвинений в антисоветской деятельности.
3 октября 1985 года Верховный суд ЭССР рассмотрел кассационную жалобу адвокатов на приговор Народного суда Октябрьского района Таллина, который судил пятерых юношей за попытку поджечь памятник жертвам коммунистического восстания 1924 года. Четверо из них, получившие различные сроки тюремного заключения, опротестовали приговор в суде высшей инстанции. Однако Верховный суд Эстонской ССР по докладу Айна Сеппика оставил приговор в силе, хотя на первом заседании Октябрьского районного суда обвинения в отношении молодых людей были признаны сфабрикованными.
В 1995 году все обвиняемые были реабилитированы.
В свою очередь Айн Сеппик заявил в интервью газете "Ээсти Пяэвалехт" о том, что он как судья не принимал в годы советской власти участия в политических процессах, и что обстоятельства данного случая он не помнит.