Работники ведомственной охраны совместно с сотрудниками линейных отделов внутренних дел и других силовых структур ведут усиленное патрулирование всех железнодорожных объектов. В первую очередь это касается мест массового скопления людей - вокзалов и станций. По громкоговорящей связи граждан систематически призывают к повышенной бдительности, рассказывают о том, как следует действовать в случае обнаружения подозрительных объектов и бесхозных вещей. На Казанском и Курском вокзалах действуют системы видеонаблюдения.
Организованы также проверки также в помещениях вагонных депо, складов, подвалов. Они направлены на выявление посторонних лиц и подозрительных предметов. Особое внимание уделяется охране мостов, тоннелей, подъездных путей. В поездах дальнего следования и электропоездах усилен режим сопровождения. Инструктаж проведен со всеми локомотивными бригадами и проводниками. В каждом вагоне электричек проверены кнопки связи "пассажир-машинист", а вагонах поездов дальнего следования - "пассажир-милиция".
На стендах и плакатах в вагонах и на станциях МЖД задолго до печальных событий были вывешены правила поведения в случае захвата пассажиров в заложники. Там также указаны телефоны экстренной связи с соответствующими службами и расположение на территории вокзала таксофонов прямой связи "пассажир-милиция".