Полковник Черненко был арестован 30 августа 2001 года в ходе совместной операции органов военной контрразведки, УФСБ и Управления по борьбе с организованной преступностью /УБОП/ УВД по Архангельской области в своем служебном кабинете в момент получения взятки в размере 1 тыс долларов от сотрудника госпиталя за предоставление ему командировки в Боснию.
При обыске на квартире и в кабинете задержанного было обнаружено и изъято 1 тыс долларов, 10 тыс рублей, 102 патрона к пистолету "Макарова", 19 трассирующих патронов и магазин к автомату "Калашникова".
Подсудимому предьявлены обвинения по статьм 30 /приготовление к преступлению/, 290 /получение взятки/, 222 /незаконное приобретение, передача, сбыт огнестрельного оружия/, 226 /хищение оружия/, 285 /злоупотребление должностными полномочиями/, 286 /превышение должностных полномочий/ Уголовного Кодекса Российской Федерации, отметили в УФСБ.