По его словам, несмотря на то, что Россия располагает огромными ресурсами пресной воды - 1 кубометр на человека - "водоемы первой величины в 2000 году не соответствовали гигиеническим стандартам". На сегодняшний день негативная ситуация сохраняется, а показатели бактериального загрязнения питьевой воды остаются на высоком уровне.
Онищенко выразил озабоченность качеством воды в главных водоемах страны: Волге, Неве, Оке, Иртыше. Оставляет желать лучшего, отметил он, и система водохранилищ, которые обеспечивают водой Москву, а также санитарно-защитная зона Подмосковья.
Далеко от идеального и состояние подземных источников. Дело в том, что владельцы подмосковных коттеджей зачастую бурят себе скважины, где хотят. По мнению замминистра, это привело к тому, что в настоящее время "артезианские скважины представляют собой решето".