Следствие считает, что Алексеев превысил свои полномочия при кредитовании Центробанком банка "СБС-АГРО" в 1998 году, что причинило ущерб государству в 5,8 млрд рублей.
В октябре 1998 года Совет директоров ЦБ РФ принял решение о кредитовании банка "СБС-АГРО" на общую сумму свыше 5 млрд рублей. Кредитование решено было производить через главное территориальное управление Центробанка РФ по Москве в случае выполнения "СБС-АГРО" ряда предъявляемых Центробанком требований. Однако Алексеев превысил свои полномочия, подписав распоряжение о перечислении денежных средств, не дожидаясь исполнения кредитуемым банком заявленных условий. В дальнейшем он неоднократно подписывал аналогичные документы, утверждает следствие.
Таким образом, с октября 1998 года по апрель 1999 года на счета "СБС-АГРО" было переведено несколько траншей кредита на общую сумму 5,8 млрд рублей. Это привело к фактической утере государством контроля за расходом названной суммы. До настоящего времени этот кредит Центробанку не возвращен, указывает следствие. Александр Алексеев не признает своей вины. По мнению его адвоката Владимира Каталикова, в действиях его подзащитного отсутствует состав преступления.
В ходе досудебного заседания 14 февраля судья Замоскворецкого суда Татьяна Чуева удовлетворила ходатайство защиты и отменила постановление Генпрокуратуры РФ от 30 марта 2001 года об отстранении Алексеева от занимаемой должности. Решением суда он был восстановлен в должности заместителя начальника Главного территориального управления Центробанка РФ по Москве.
