Согласно внесенным уточнениям, в полномочия ФЭК входит государственное регулирования цен и тарифов на продукцию и услуги не только субъектов естественных монополий в топливно-энергетическом комплексе, но и на транспорте.
Основными функциями ФЭК России являются регулирование и контроль деятельности субъектов естественных монополий в сферах транспортировки нефти и нефтепродуктов по магистральным трубопроводам, транспортировки газа по трубопроводам, железнодорожных перевозок, услуг по передаче электрической и тепловой энергии, услуг транспортных терминалов, портов и аэропортов, включая ценовое регулирование, а также определение потребителей, подлежащих обязательному обслуживанию, или установление минимального уровня их обеспечения в случае невозможности удовлетворения в полном объеме потребностей в товарах /работах, услугах/, реализуемых субъектом естественной монополии.