По сообщению греческого агентства МПА, Афины и Анкара до сих пор не могут прийти к согласию в вопросе разграничения территориальных вод и принадлежности шельфа в Эгейском море. Турция считает, что принадлежность вод должна определяться протяженностью турецкого побережья. Греция утверждает, что наличие ее островов возле турецкого берега дает ей также право на территориальные воды. Не могут договориться стороны и по воздушному пространству над Эгейским морем.
Как отмечают наблюдатели, несмотря на улучшение отношений между двумя странами в последние годы, серьезные территориальные разногласия остаются. Договоренность о необходимости проведения переговоров для решения спорных проблем был достигнута еще в 2001 году в Вашингтоне. Однако встречи начались только сейчас. Греция готова перенести решение территориальных споров в международный суд в Гааге, Турция пока выступает против.