В соответствии с распределением обязанностей, сам председатель правительства контролирует деятельность министерства по атомной энергии, министерства имущественных отношений, министерства промышленности, науки и технологий, Государственного таможенного комитета, Российского фонда федерального имущества. Он руководит комиссией правительства РФ по военно-техническим вопросам и координирует взаимодействие правительства с Центральным банком и Российской академией наук.
Кроме того, премьер-министр обеспечивает в рамках компетенции правительства координацию работы федеральных органов исполнительной власти, руководство деятельностью которых осуществляет непосредственно президент России. Речь идет о таких ведомствах, как министерство внутренних дел, МЧС, МИД, Минобороны, Минюст, Государственная фельдъегерская служба, Служба внешней разведки, Федеральная служба безопасности. Федеральная служба налоговой полиции, Федеральная пограничная служба, ФАПСИ, Управление делами президента РФ и комиссия РФ по военно-техническому сотрудничеству с иностранными государствами.
Заместитель председателя правительства Алексей Кудрин координирует вопросы экономического прогнозирования социально-экономического развития страны, вопросы рынка ценных бумаг, антимонопольной политики и поддержки предпринимательства, внешнеэкономических связей, валютного контроля и противодействия легализации доходов, полученных преступным путем. Он руководит министерством финансов и непосредственно координирует и контролирует деятельность Минэкономразвития РФ, МНС, МАП, Госкомитета по статистике, федеральной комиссии по рынку ценных бумаг, Федеральной службы по финансовому оздоровлению /банкротству/, Российского агентства по государственным резервам, Комитета по финансовому мониторингу. Кудрин также рассматривает вопросы деятельности Государственного таможенного комитета в части обеспечения поступления доходов в бюджет, вопросы взаимодействия с Центральным банком в части денежно-кредитной политики.
Вице-премьер Виктор Христенко координирует вопросы федеративных отношений, политику ценообразования на товары и услуги естественных монополий, развитие деятельности топливно-энергетического комплекса, включая ядерную энергетику, обеспечение экономики и населения страны топливно-энергетическими ресурсами, а также вопросы развития транспорта и дорожного хозяйства, систем связи и телекоммуникаций, строительства и реформы ЖКХ, а также вопросы использования недр, охраны окружающей среды и реализации государственной политики в сфере отношений со странами СНГ и Европейским союзом. Он непосредственно координирует и контролирует деятельность Минэнерго, Минприроды, министерство транспорта, министерство по связи и информатизации, министерство путей сообщения, Государственный комитет по строительству и жилищно-коммунальному комплексу, а также Федеральной энергетической комиссии.
Заместитель председателя правительства Алексей Гордеев координирует вопросы аграрной политики и агропромышленного комплекса, рыболовства и переработки рыбной продукции, оборота земель сельхозназначения, геодезии и картографии, гидрометеорологии и мониторинга окружающей среды. Гордеев возглавляет министерство сельского хозяйства и координирует и контролирует деятельность Госкомитета по рыболовству, Федеральной службы геодезии и картографии, Федеральной службы земельного кадастра, Федеральной службы по гидрометеорологии и мониторингу окружающей среды, а также Государственной хлебной инспекции при правительстве РФ.
Заместитель председателя правительства Валентина Матвиенко координирует вопросы социальной и миграционной политики, трудовых отношений, образования, здравоохранения, культуры, физической культуры, спорта и туризма, государственной молодежной политики и вопросы соотечественников за рубежом. Матвиенко обеспечивает взаимодействие правительства с профсоюзами, общественными движениями, религиозными организациями и средствами массовой информации. Она непосредственно координирует и контролирует деятельность министерства труда, министерства здравоохранения, министерства образования, министерства культуры, Минпечати, Госкомитета по физкультуре и спорту, Федеральной архивной службы, Пенсионного фонда России, Фонда социального страхования и Фонда обязательного медицинского страхования.
Михаил Касьянов также утвердил, что министр экономического развития и торговли РФ Герман Греф координирует и контролирует деятельность Центра экономической конъюнктуры при правительстве РФ и работу Центра экономических реформ при правительстве РФ.
Согласно распределению обязанностей, министр промышленности, науки и технологий Илья Клебанов рассматривает и ведет вопросы Российского авиационно-космического агентства, Российского агентства по боеприпасам, Российского агентства по обычным вооружениям, Российского агентства по системам управления, Российского агентства по судостроению, Российского агентства по патентам и товарным знакам. Клебанов координирует и контролирует деятельность Российского фонда фундаментальных исследований и Российского гуманитарного научного фонда.
Глава МЧС Сергей Шойгу, согласно утвержденному распределению обязанностей, рассматривает и ведет вопросы федерального надзора по ядерной и радиационной безопасности, а также федерального горного и промышленного надзора.
Руководитель аппарата правительства РФ - министр РФ Игорь Шувалов координирует вопросы законопроектной деятельности правительства, рассматривает и ведет вопросы деятельности Госкомитета по стандартизации и метрологии, координирует и контролирует деятельность Института законодательства и сравнительного страноведения при правительстве РФ, Академии народного хозяйства при правительстве РФ и финансовой академии при правительстве РФ.
