В соответствии с распределением обязанностей, сам председатель правительства контролирует деятельность Министерства по атомной энергии, Министерство имущественных отношений, Министерство промышленности, науки и технологий, Государственного таможенного комитета, Российского фонда федерального имущества. Он руководит комиссией правительства РФ по военно-техническим вопросам и координирует взаимодействие правительства с Центральным банком и Российской академией наук.
Кроме того, премьер-министр обеспечивает в рамках компетенции правительства координацию работы федеральных органов исполнительной власти, руководство деятельностью которых осуществляет непосредственно президент РФ. Речь идет о таких ведомствах, как министерство внутренних дел, МЧС, МИД, Минобороны, Министерство юстиции, Государственная фельдъегерская служба, Служба внешней разведки, Федеральная служба безопасности. Федеральная служба налоговой полиции, Федеральная пограничная служба, ФАПСИ, Управление делами президента РФ и комиссия РФ по военно-техническому сотрудничеству с иностранными государствами.
