Отличительной особенностью деятельности МЖА является договорная форма работы - в год заключается до 200 договоров на различные формы обслуживания. Среди клиентов агентства - Госдума и Совет Федерации, ФСБ, МЧС и другие ведомства и организации.
Требования международных стандартов обязывают агентство обеспечивать соответствующие нормы обслуживания пассажиров. Международная справочная система дает возможность предоставлять пассажирам информацию о любом железнодорожном маршруте в масштабах Европы.
МЖА постоянно совершенствует технологии работы, чтобы исключить перепродажу билетов с рук. Кроме того, для максимального сокращения очередей в кассах к началу летних перевозок будет увеличено количество пунктов продажи билетов. Введена новая услуга - заказ билетов через Интернет.