В 1856-1860 годах он продолжил обучение в Петербургской Академии художеств у пейзажиста С.М. Воробьева.
Успехи молодого художника были отмечены двумя Малыми серебряными медалями, Большой серебряной медалью /1858 год/, Малой золотой медалью /1859 год/.
В 1860 году за два валаамских пейзажа Шишкин получил Большую золотую медаль и право на заграничную командировку, куда он отправился в 1862 году.
В 1862-65 годах он - пенсионер Академии художеств в Мюнхене, Праге, Дюссельдорфе.
В 1865 году возвращается в Россию и за картину "Вид в окрестностях Дюссельдорфа" получает звание академика.
В 1873 году академия возвела его в звание профессора за картину "Лесная глушь".
После вступления в действие нового устава академии художеств, в 1892 году Шишкин был приглашен руководить ее учебной пейзажной мастерской, но он занимал эту должность недолго.
Произведения Шишкина "Рубка леса", "При закате", "Полдень в окрестностях Москвы", где раскрываются особенности национального пейзажа, отвечали направлению, которое развивалось впоследствии Товариществом передвижных художественных выставок. В 1870 году он вместе с И.Н.Крамским, В.Г.Перовым, Г.Г.Мясоедовым, А.К.Саврасовым, Н.Н.Ге и другими стал членом-учредителем Товарищества.
Шишкин создал монументальные и жизнеутверждающие образы родной природы, созвучные идеям исторического бытового и портретного жанра передвижников, а в своих лучших произведениях поднялся до широкого обобщения, воспевая национальный пейзаж: "Рубка леса", "Полдень в окрестностях Москвы", "Сосновый лес", "Горелый лес", "Рожь", "Дебри", "Пасека", "Еловый лес" , "Утро в сосновом лесу" /медведи написаны К.А.Савицким/, "Корабельная роща", "Полянка с соснами", "Лесная глушь" и "Поляна".
Наряду с живописными работами особое место в творчестве Шишкина принадлежит графике. Художник мастерски владел искусством рисунка и гравюры. Его рисунок претерпел такую же эволюцию, как и живопись.
Шишкин скоропостижно скончался в Петербурге 20 марта 1898 года.
/По материалам Редакции информационно-справочного обеспечения РИА "Новости", 25 января/