64-страничное обвинительное заключение по Хорватии содержит список имен сотен убитых сербами хорватов. Милошевичу вменяется в вину разработка и претворение в жизнь преступного плана по убийству или депортации из примерно третьей части территории Хорватии хорватов и других представителей несербского населения с целью создания там государства, в котором бы доминировали сербы.
Среди проистекающих из этого плана преступлений в обвинительном заключении, в частности, значатся убийство в ноябре 1991 года 255 хорватов и других представителей несербского населения, захваченных сербами в больнице города Вуковар, обстрел города Дубровник, приведший к гибели 43 мирных граждан, расстрел 110 человек около хорватской деревни Бачин и не менее 64 жителей деревни Скабрня, а также убийство, незаконное заключение под стражу и пытки тысяч хорватов в других населенных пунктах. Всего, как утверждается в обвинительном заключении, этническим чисткам подверглась территория Хорватии, на которой до войны проживало почти 170 тыс хорватов.