Однако катастрофа на Чернобыльской АЭС сильно повлияла на настроения в обществе, и экологические организации, некоторые политические деятели и население выступили против возведения ТЭЦ. Борьба ОАО "Мосэнерго" за право построить электростанцию продлилась несколько лет. При содействии природоохранных организаций и под наблюдением государственных контролирующих органов компания скорректировала проект строительства ТЭЦ. В нем были учтены самые передовые достижения в энергетическом машиностроении и технологии сжигания топлива. В итоге проект был признан экологически безопасным, и ОАО "Мосэнерго" получило разрешение на строительство. В 1992 году станция начала работу.
Сегодня филиал московской энергетической компании ТЭЦ-27 считается самой экологически чистой электростанцией в России. Значительным достижением ТЭЦ-27 является разработанная с участием коллектива предприятия автоматизированная система управления электростанцией. В 1996 году разработка была удостоена премии правительства России в области науки и техники.
В связи с тенденцией роста энергопотребления в Московском регионе, ОАО "Мосэнерго" намерено в ближайшие годы развивать установленную мощность ТЭЦ-27. В 2004 году на станции планируется внедрить третий энергоблок, созданный с применением парогазовых технологий, сообщили в пресс-службе "Мосэнерго".