Сейчас ИД "Коммерсантъ" - это ежедневная газета "Коммерсантъ", ежедневная газета "Коммерсантъ в регионах", аналитический еженедельник "Коммерсантъ ВЛАСТЬ", экономический еженедельник "Коммерсантъ ДЕНЬГИ", автомобильный журнал "Автопилот", ежемесячный журнал о шоппинге "Коммерсантъ КАТАЛОГ", ежемесячный деловой журнал "Секрет Фирмы", культовый европейский журнал "CITIZEN K" и т.д.
В изданиях и технических службах ИД "Коммерсантъ" работают свыше 800 человек. Аудитория печатной продукции ИД "Коммерсантъ" превышает 1 млн человек.
В 1999 году 100% акций ИД "Коммерсантъ" приобрели Борис Березовский и Бадри Патаркацишвили, имеющие совместный бизнес, который в основном находится за пределами России. За последние пять лет они продали свои доли в "Русале", ОРТ и "Сибнефти", сохранив лишь все акции издательского дома "Коммерсантъ".
17 февраля 2006 года стало известно, что один из совладельцев газеты Борис Березовский продает свою долю собственности в ИД "Коммерсантъ", а вместе с ним и другие свои активы, второму совладельцу - Бадри Патаркацишвили, который возглавляет совет директоров ИД "Коммерсантъ".
В августе 2006 года стало известно имя нового владельца издательского дома "Коммерсантъ"; им стал — российский бизнесмен Алишер Усманов.
14 декабря 2011 г. миллиардер Михаил Прохоров направил оферту по покупке ИД "Коммерсант" владельцу издательского дома Алишеру Усманову, сообщил РИА Новости представитель группы "Онэксим", принадлежащей Прохорову. "Представители Усманова должны были ее уже получить", - сказал собеседник.
Днем ранее, во вторник, 13 декабря, сообщалось, что Прохоров заинтересовался издательским домом, который оказался в центре скандала в связи с публикацией в последнем номере журнала "Власть". В принадлежащей ему группе "Онэксим" факт переговоров по покупке "Коммерсанта" подтвердили. Однако вечером Усманов заявил РИА Новости, что не планирует продавать издательский дом "Коммерсант" и переговоров с Прохоровым не ведет.
