С 2000 по 2005 год продолжался резонансный конфликт между администрацией Большого театра и знаменитой балериной Анастасией Волочковой.
В 2000 году Волочкова после гастролей в Великобритании была вынуждена покинуть Большой театр, а в 2001 году по требованию хореографа ГАБТ Юрия Григоровича балерина была вновь приглашена на сцену Большого, чтобы участвовать в постановке балета "Лебединое озеро"
В 2003 году администрация Большого театра отказалась подписать с балериной очередной контракт на год, ограничившись четырьмя месяцами. Волочкова в ответ обратилась в суд и подняла полемику в СМИ о правомочности решения руководства театра.
В сентябре 2003 года балерина была официально уволена из труппы. Формальным поводом стало то, что "балерина не соответствует требованиям физической формы и ей невозможно подобрать партнера".
Евгений Иванченко, единственный партнер балерины, получив травму, уволился из театра.
Хотя в итоге суд принял сторону Анастасии Волочковой, в результате тяжбы она все таки покинула труппу.
В марте 2011 года в Большом театре разразился громкий скандал. В его центре оказался управляющий балетной труппой театра Геннадий Янин. В интернете были выложены порочащие его фотографии порнографического содержания. Была сделана почтовая рассылка на 3848 адресов по всему миру, в том числе в крупнейшие газетные издания и на телеканалы, со ссылками на снимки. Авторы компрометирующей акции добились желаемого результата — Янин написал заявление об увольнении.
В ноябре 2011 года известные танцовщики Иван Васильев вместе со своей партнершей Натальей Осиповой со скандалом покинули Большой театр и были приняты в балетную труппу Михайловского театра в Санкт Петербурге. Смена театров, которую артисты объяснили "нехваткой репертуара" и "творческой свободы" в Большом, вызвала широкий резонанс и спровоцировала конфликт между руководителями. В частности, гендиректор ГАБТ Анатолий Иксанов не хотел подписывать заявления артистов об уходе, в ответ на что гендиректор Михайловского театра Владимир Кехман собирался запретить Васильеву и Осиповой появляться на сцене Большого.
Иксанов обвинил коллегу в том, что тот фактически поставил руководству ГАБТ ультиматум и пригрозил запретить бывшим примам балета Большого работать на его сцене. Тем не менее, проработав в Большом две недели после подачи заявления об уходе, артисты были уволены.
В 2011 году разгорелся громкий скандал между солистом балета Большого театра Николаем Цискаридзе и руководством театра.
В декабре 2011 — январе 2012 года артист выступил с критикой репертуара театра и политики руководства Большого театра. На фоне скандальных заявлений в декабре 2011 года Цискаридзе и еще один педагог совместитель, солист ГАБТа Ян Годовский, получили уведомлении об увольнении с должностей преподавателей. Цискаридзе, в отличие от Годовского, согласившегося подписать заявление об увольнении, с решением руководства ГАБТа не согласился, объявив о намерении опротестовать в суде расторжение своего преподавательского контракта.
Однако в январе 2012 года руководство театра решило не прерывать с артистом контракт о репетиторской работе.
Цискаридзе неоднократно заявлял, что напряженные отношения вызваны в первую очередь его критикой в адрес руководства Большого. В частности, он не скрывал своего отношения к недавно прошедшей реконструкции, которую назвал "вандализмом".
В ноябре 2012 года ряд признанных деятелей культуры направили президенту России Владимиру Путину коллективное письмо с просьбой назначить Николая Цискаридзе на должность директора главного театра страны. Авторами письма выступили 12 человек: актер Владимир Андреев, тренер Ирина Винер, режиссер Галина Волчек, педагог Большого Юрий Владимиров, хореограф Михаил Лавровский, знаменитая балерина Мария Леонова, оперная певица Елена Образцова, тенор Зураб Соткилава, режиссеры Марк Захаров и Олег Табаков, а также актеры Алиса Фрейндлих и Геннадий Хазанов.
Ранее министр культуры Владимир Мединский сообщил о продлении трехлетнего контракта с Иксановым еще на один год. Таким образом, он останется главой ГАБТа до конца 2014 года.
17 января 2013 года в Москве на улице Троицкая неизвестный преступник в маске напал на художественного руководителя балета Большого театра Сергея Филина, плеснув ему в лицо жидкость с кислотой. Филин обратился за помощью к охраннику расположенной поблизости автостоянки, после чего был госпитализирован в больницу с ожогами лица третьей степени и ожогами глаз. По словам пресс-секретаря Большого театра, балетмейстеру ранее угрожали, прокалывали шины, а также взломали веб-сайт. 18 января по факту нападения было заведено уголовное дело по статье "умышленное причинение тяжкого вреда здоровью".
Следствием рассматривается в качестве основной версия, связанная с профессиональной деятельностью потерпевшего, однако не списываются со счетов и версии бытового характера.
Материал подготовлен на основе информации РИА Новости и открытых источников