Идет загрузка...
Произошла ошибка... Повторить
slide

Ученые из МФТИ нашли способ быстро провести "перепись" микрофлоры

Рентгеновский снимок одиночной бактерии (справа) и вид ее «изнутри» в представлении художника (слева)
Ученые из МФТИ создали методику быстрой оценки численности и генетического разнообразия различных представителей микрофлоры в человеческом организме, используя своеобразные "ключевые слова" в их ДНК.

МОСКВА, 2 мар – РИА Новости. Российские биоинформатики из московского Физтеха нашли способ быстро провести полную генетическую перепись всех микробов, обитающих в кишечнике и в других тканях тела человека, что поможет определить, как состав микрофлоры влияет на здоровье людей, сообщает пресс-служба ВУЗа.

"Интересно, что гены можно рассматривать не только как участки ДНК с закодированными в них белками, но и как просто информацию. Именно такое информационное различие позволило нам выявить новые участки ДНК — не описанные в каталоге известных генов. Интересно посмотреть, как такой подход будет использоваться другими группами", — заявил Дмитрий Алексеев, один из авторов статьи и заместитель заведующего Лабораторией системной биологии МФТИ.

Тело человека, по последним подсчетам ученых, содержит в себе примерно 39 триллионов бактерий, обитающих в кишечнике, ротовой полости и в других тканях, что немногим больше, чем общее число клеток в нашем организме. Исследования последних годов показывают, что микробы активно влияют на наше здоровье, управляя работой иммунной системы, предрасположенностью к развитию ожирения и сахарного диабета, а также влияя на работу некоторых функций мозга.

Алексеев и его коллеги придумали способ, позволяющий гораздо быстрее и эффективнее изучать структуру микрофлоры, оценивать ее генетическое разнообразие и сравнивать микрофлоры двух людей между собой, не "сортируя" бактерии на отдельные штаммы и роды.

Сегодня при проведении такого анализа ученые применяют особые "эталонные геномы" разных видов бактерий, которые они используют для определения присутствия их представителей в изучаемых образцах микрофлоры. Не все бактерии, обитающие в нашем кишечнике или в других органах, имеют подобный эталон, поэтому такая перепись бывает неполной, и к тому же проводится крайне медленно из-за необходимости выращивать образцы изучаемых бактерий.

Здоровое питание
Голодовки улучшают микрофлору кишечника, выяснили ученые

Российские ученые представили в журнале BMC Bioinformatics способ отказаться от этих "эталонов", заменив их на своеобразные "ключевые слова" – последовательности из нескольких генетических букв-нуклеотидов, которые часто встречаются в ДНК всех бактерий.

Как выяснили Алексеев и его коллеги, частота употребления этих "слов" для каждого штамма микробов является уникальной, что позволяет очень быстро проводить генетическую "перепись" среди микрофлоры, анализируя то, какие "ключевые слова" встречаются в образцах ДНК ее микробов.

Мамы с детьми. Архив
Ученые нашли связь между микрофлорой кишечника, ожирением и диабетом

Для проверки работы этой методики российские генетики сравнили между собой образцы микрофлоры кишечника у жителей Китая и США, хорошо изученные при помощи традиционных методов "генетической переписи". Этот тест не только показал, что методика Алексеева и его коллег работает точнее и быстрее, чем старые способы изучения метагеномных различий, но и позволяет находить особо "скрытных" обитателей нашего тела.

В частности, ученые из МФТИ подтвердили, что в микрофлоре человека присутствует вирус — бактериальный фаг crAssphage, обычно ускользающий от исследователей при использовании традиционного метода.

Как надеются ученые, их методика позволит более эффективно и точно находить отличия между метагеномами разнообразных бактериальных сообществ, что в частности может помочь в изучении, диагностике и лечении многих заболеваний человека.

РИА Наука
Обсуждение
1 пользователь оставил 1 комментарий
  • Суть метода в общих чертах ясна, но в статье нет даже общего описания самой процедуры и инструментария анализа.
    23:28
    02.03.2016

Партнеры





Наверх
Авторизация
He правильное имя пользователя или пароль
Войти через социальные сети
Регистрация
E-mail
Пароль
Подтверждение пароля
Введите код с картинки
He правильное имя пользователя или пароль
* Все поля обязательны к заполнению
Восстановление пароля
E-mail
Инструкции для восстановления пароля высланы на
Смена региона
Идет загрузка...
Произошла ошибка... Повторить
правила комментирования материалов

Регистрация пользователя в сервисе РИА Клуб на сайте Ria.Ru и авторизация на других сайтах медиагруппы МИА «Россия сегодня» при помощи аккаунта или аккаунтов пользователя в социальных сетях обозначает согласие с данными правилами.

Пользователь обязуется своими действиями не нарушать действующее законодательство Российской Федерации.

Пользователь обязуется высказываться уважительно по отношению к другим участникам дискуссии, читателям и лицам, фигурирующим в материалах.

Публикуются комментарии только на тех языках, на которых представлено основное содержание материала, под которым пользователь размещает комментарий.

На сайтах медиагруппы МИА «Россия сегодня» может осуществляться редактирование комментариев, в том числе и предварительное. Это означает, что модератор проверяет соответствие комментариев данным правилам после того, как комментарий был опубликован автором и стал доступен другим пользователям, а также до того, как комментарий стал доступен другим пользователям.

Комментарий пользователя будет удален, если он:

  • не соответствует тематике страницы;
  • пропагандирует ненависть, дискриминацию по расовому, этническому, половому, религиозному, социальному признакам, ущемляет права меньшинств;
  • нарушает права несовершеннолетних, причиняет им вред в любой форме;
  • содержит идеи экстремистского и террористического характера, призывает к насильственному изменению конституционного строя Российской Федерации;
  • содержит оскорбления, угрозы в адрес других пользователей, конкретных лиц или организаций, порочит честь и достоинство или подрывает их деловую репутацию;
  • содержит оскорбления или сообщения, выражающие неуважение в адрес МИА «Россия сегодня» или сотрудников агентства;
  • нарушает неприкосновенность частной жизни, распространяет персональные данные третьих лиц без их согласия, раскрывает тайну переписки;
  • содержит ссылки на сцены насилия, жестокого обращения с животными;
  • содержит информацию о способах суицида, подстрекает к самоубийству;
  • преследует коммерческие цели, содержит ненадлежащую рекламу, незаконную политическую рекламу или ссылки на другие сетевые ресурсы, содержащие такую информацию;
  • имеет непристойное содержание, содержит нецензурную лексику и её производные, а также намёки на употребление лексических единиц, подпадающих под это определение;
  • содержит спам, рекламирует распространение спама, сервисы массовой рассылки сообщений и ресурсы для заработка в интернете;
  • рекламирует употребление наркотических/психотропных препаратов, содержит информацию об их изготовлении и употреблении;
  • содержит ссылки на вирусы и вредоносное программное обеспечение;
  • является частью акции, при которой поступает большое количество комментариев с идентичным или схожим содержанием («флешмоб»);
  • автор злоупотребляет написанием большого количества малосодержательных сообщений, или смысл текста трудно либо невозможно уловить («флуд»);
  • автор нарушает сетевой этикет, проявляя формы агрессивного, издевательского и оскорбительного поведения («троллинг»);
  • автор проявляет неуважение к русскому языку, текст написан по-русски с использованием латиницы, целиком или преимущественно набран заглавными буквами или не разбит на предложения.

Пожалуйста, пишите грамотно — комментарии, в которых проявляется пренебрежение правилами и нормами русского языка, могут блокироваться вне зависимости от содержания.

Администрация имеет право без предупреждения заблокировать пользователю доступ к странице в случае систематического нарушения или однократного грубого нарушения участником правил комментирования.

Пользователь может инициировать восстановление своего доступа, написав письмо на адрес электронной почты moderator@rian.ru

В письме должны быть указаны:

  • Тема – восстановление доступа
  • Логин пользователя
  • Объяснения причин действий, которые были нарушением вышеперечисленных правил и повлекли за собой блокировку.

Если модераторы сочтут возможным восстановление доступа, то это будет сделано.

В случае повторного нарушения правил и повторной блокировки доступ пользователю не может быть восстановлен, блокировка в таком случае является полной.

Чтобы связаться с командой модераторов, используйте адрес электронной почты moderator@rian.ru или воспользуйтесь формой обратной связи.